El desierto de Sahara ocupa gran parte de su territorio, este es atravesado por solamente un río el Nilo, que es el encargado de regar la zona fértil del país. El río ha traído a Egipto civilizaciones, culturas y desarrollo de imperios a lo largo de su historia. Este desemboca en el Mediterráneo formando un delta de unos 200 Km de extensión en dirección norte-sur y entre Alejandría y Damieta en dirección este-oeste.
Egipto posee clima desértico y sufre de escasez de lluvias, sus noches son frías, y sus días calurosos, el gobierno egipcio cuida de 21 Parques Naturales con una superficie total de 53.000 Km², que es el 5% del territorio nacional.El más grande de ellos es el Parque Nacional de Elba, al sur, con distintos ecosistemas: manglares del Mar Rojo, 22 islas, arrecifes de coral, dunas costeras, pantanos salados costeros, llanuras costeras desérticas y la zona de montañas: Jabal Elba de 1437 m de altitud, Jabal Ebruq y Al Daeeb